grunt-bower-taskでプロジェクトルートにファイルをダウンロードする

Gruntfile.coffee

grunt.initConfig
  bower:
    install:
      options:
        cleanup: true
        install: true
        layout: (type, component) ->
          # project root
          '..'

と書いてあげればOKみたいです。ちなみに、

grunt.initConfig
  bower:
    install:
      options:
        cleanup: true
        install: true
        targetDir: '.'

とか書くとリポジトリ（プロジェクトルート）丸ごと消してくれるので（なんでだろ？）お気をつけください。
cleanupを指定してなければ大丈夫だったんだろうけどね！